開発中止になった64版と発売されたGBA版ではストーリーが多少異なっています。 大筋のストーリーは一緒ですが、ストーリーの構成数が異なっています。 GBAではご存知のとおり8章で構成されています。 一方64版では12章から構成されていました。 ROMの容量の都合などで削られたのではないでしょうか。 64版ではGBA版の1章「とむらいの夜」の前に双子の冒険の章などがありました。 物語以外でもPSIの名称がマホウだったりと、あちこち違っていたようです。